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三代测序综合服务

服务介绍  Service Introduction


 

            第三代测序技术(TGS)又称单分子测序,通过光学、纳米等技术直接解析单个DNA分子的碱基信号差异,实现序列读取。主流平台包括Pacific Biosciences的SMRT(荧光信号测序)和Oxford Nanopore的纳米孔测序(电流信号测序),其核心优势在于无需扩增的单分子直接测序。该技术凭借超长读长(可达数万碱基),广泛应用于复杂基因组组装、全长转录组分析及微生物群体研究等领域,可突破重复序列和杂合区域的组装瓶颈。在临床检测中,其高精度结构变异检测能力(如缺失、倒位)、对短串联重复(STR)和甲基化特征的识别优势,使其在肿瘤基因组学和罕见病诊断中具有显著价值。


服务优势  Service Advantages



        单分子测序无需PCR扩增,直接对单条DNA/RNA分子测序,避免扩增偏差,保留原始碱基修饰信息(如甲基化)。

        超长读长单次测序可达数千至数万碱基,显著提升复杂基因组拼接效率,解决重复序列和杂合区域组装难题。

        高精度与实时性测序精度高达99.9999%,部分技术可实时输出数据(如纳米孔测序),满足动态监测需求。

        多应用场景覆盖适用于全长转录组分析、结构变异检测(如缺失、倒位)、微生物快速鉴定及表观遗传研究。

        直接测序能力可直接读取RNA序列,无需反转录,减少中间环节误差,提升实验效率与准确性。

 

订购信息 


表格5(无价格)



测序合格样品要求 


         测序合格样品要求


         一、菌液及平板


        1.1体积≥200uL的新鲜菌液;也可以提供≥5ml菌液或沉淀菌体直接提取质粒。送样前请做好样品封存工作,防止漏液。


        1.2培养好的平板或划线平板


        *特殊菌液标注培养条件;古菌需自行培养后送样;噬菌体样本不接收,感谢理解。


        二、质粒及PCR产物


        2.1样品浓度:电泳有明显条带,且浓度(Qubit定量)≥10 ng/uL;


        2.2样品纯度(Nanodrop检测): OD260/280在1.8-2.0,OD260/230在2.0-2.2;溶液中不含去污剂、表面活性剂、变性剂,螯合剂和高浓度的盐,蛋白质


        2.3样品需求量:体积≥20 uL,总量约200ng,50kb以上大质粒需要总量≥500ng;


        2.4样品溶于超纯水中(双蒸水、Milli-Q等),不要使用TE溶解,会影响后续反应。


        细菌完成图合格样本要求


        一、样本类型:


        (1)菌沉淀:细菌、放线菌(致病菌除外)。致病菌目录请参考《人间传染的病原微生物目录(2023版)》表2。危险等级分类为二级的病原不接受。危险等级分类为三级的病原,请灭活后送检。


        (2)基因组DNA:细菌、放线菌中提取的基因组。支原体、衣原体、立克次体、螺旋体咨询。


        二、样本要求:


        (1)菌沉淀:液体培养至对数期,0D600约0.6-0.8,收集菌体 3-5ml,1.5ml离心管低温4度离心,弃上清,保留管底菌体,液冷冻。建议同时送 1-2管重复。


        (2)基因组DNA:DNA 样品澄清透明,总量≥ 3μg;DNA 纯度OD260/280在1.8-2.0之间,OD260/OD230 在2.0-2.2之间;DNA 浓度≥50 ng/μL;DNA完整无降解,无RNA、蛋白质等污染,DNA 片段平均长度


        菌种鉴定合格样本要求


        一、纯菌:接受平板单克隆、菌液、菌沉淀,真菌菌丝。不接受可能的致病菌。冰袋邮寄至实验室。 


        二、混合菌:接收未分离培养的污染菌等。将污染菌部分转移至 1.5 mL EP 管中,冰袋邮寄至实验室。


        AAV测序合格样本要求


        需要总量至少为1.0×10^12完整病毒拷贝,溶解在200µL PBS中(样本浓度5.0×10^9 GC/μL),冰袋寄送至实验室。

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