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STR细胞株鉴定

为什么细胞鉴定不可省？  Why Cell Authentication Matters

    不同类型细胞在制备、扩增及传代等体外操作过程中，经常发生细胞间交叉污染。最著名的例子就是HeLa细胞对其他细

胞株的污染——据统计全球有数百个"独立建立"的细胞系实为HeLa衍生物。

    有效判断细胞的种属来源、确保在制备过程中无不同种属间细胞交叉污染，是细胞质量控制中的最重要内容之一。

    无论是用于生物制品生产用的各种细胞基质或是治疗性细胞产品，均有控制种属间细胞交叉污染的质量要求——尤其是

在制备过程中使用了其他种属细胞作为滋养层的治疗性细胞产品。

技术原理  Technical Principle

    STR（Short Tandem Repeat，短串联重复序列）基因座由3～7个碱基对的核心重复单元串联而成，广泛分布于人类

基因组中，具有高度多态性，被视为细胞的"DNA指纹"。

    该标记可通过PCR技术进行扩增，其等位基因差异源自核心重复序列拷贝数的不同。经毛细管电泳分离后，借助荧光检

测即可获得分型图谱。最终，通过与权威细胞STR数据库进行比对分析，可准确鉴定样品所属细胞系，或识别潜在的交叉

污染来源。

服务优势  Service Advantages

检测位点信息  Detection site information

送样指南：为保证样品质量和STR鉴定效果，不建议客户直接送检自行提取的基因组DNA。

推荐方式：直接寄送细胞沉淀——用PBS将细胞洗涤2遍后，收集于一干净无菌离心管中，离心去上清即得细胞沉淀（细胞

数 ≥ 10⁶ 个，沉淀应至少肉眼可见）。用封口膜封好管口防泄漏，随冰袋寄送至我司即可。

服务流程  Technical Procedures

报告示例  Report Sample

STR 细胞株鉴定报告示例 —— 完整报告包含原始图谱、分型数据、数据库比对结果及鉴定结论

适用领域   Applicable fields

mtDNA 动物种属鉴定  Mitochondrial DNA Species Identification

        双引擎技术路线：在STR精确鉴定之外，我们新增mtDNA种属鉴定服务，形成"STR精确鉴定 + mtDNA广谱筛查"的双重保

障体系。对首次送检或不清楚细胞背景的客户，建议采用联合鉴定方案。

▎什么是 mtDNA 鉴定？

        线粒体DNA（mtDNA）是存在于细胞线粒体中的独立遗传物质，具有分子量小、高拷贝数、进化速率快、母系遗传非重组等特

征，是动物种属鉴定的理想分子标记。

图1：人类线粒体DNA环形基因组图谱 —— 展示COI、Cyt b、12S/16S rRNA、ND1-6等基因在环形基因组上的位置分布

图2：mtDNA基因组成结构图 —— 22个tRNA基因 + 13个蛋白编码基因 + 2个rRNA基因，色块区分不同功能区

▎技术原理与方法

▎适用场景

• 细胞交叉污染筛查 —— 快速判断培养细胞是否混入其他物种来源的细胞（如HeLa污染、小鼠细胞污染人源细胞等

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• 跨种属污染）

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• 未知细胞系鉴定 —— 对缺乏文献STR数据的细胞系（尤其非常见物种），通过mtDNA测序实现物种归属初步判断

• 
  

• 生物制品质量控制 —— 疫苗、抗体等生产用细胞基质的种属确证，确保无外源细胞成分

• 
  

• 治疗性细胞产品放行 —— 涉及异种滋养层（如小鼠feeder layer）的干细胞/免疫细胞治疗产品的种属安全性评估

• 
  

• 法医/食品安全 —— 毛发、羽毛、肉类、皮张、骨骼、血液等各类组织样品的物种来源鉴定

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▎实验流程

mtDNA种属鉴定完整实验流程图 —— 从样品采集→DNA提取→PCR扩增(COI 648bp)→质量验证→测序→BLAST比对→物种鉴定判定（参考文献：The Open Forensic Science Journal, 2014）

▎技术参数

        PCR反应体系（50 μL）：1 ng 基因组DNA + 1× 反应缓冲液 + 2.5 U DNA聚合酶 + 0.15 mM 各引物

        扩增程序：95°C 预变性10 min → 35个循环（95°C 45s / 50°C 45s / 72°C 90s）

        产物验证：2% 琼脂糖凝胶电泳，阳性样品应产生预期大小的单一条带

        序列分析：采用NCBI BLAST在线工具与GenBank/EMBL/DDBJ公共数据库进行同源性比对，按相似度排序返回最佳匹配结果

▎STR vs mtDNA —— 如何选择？

推荐策略：对于首次送检或不清楚细胞背景的客户，建议采用"STR + mtDNA"联合鉴定方案——先用mtDNA排除跨种属污染可能，再用STR精确定位细胞株身份，双重保险确保万无一失。

权威数据参考  Reference Databases & Friendly Links

以下整理了细胞鉴定领域的权威公共数据库链接，供客户自助查询和国际比对参考：

https://www.atcc.org/search-str-database

https://celldive.dsmz.de/str

其他常用参考资源：

• JCRB（日本） —— 日本遗传学研究资源中心细胞银行 STR 数据
• ECACC（英国） —— 欧洲细胞培养收藏中心细胞鉴定数据
• NCBI GenBank —— 美国国家生物技术信息中心核酸序列数据库（用于mtDNA BLAST比对）
• NCBI PopSet —— 种群研究序列集合（含大量物种mtDNA参考序列）

资料下载  Download

    细胞株STR分型鉴定委托书

常见问题解答  Frequently Asked Questions

1、细胞STR鉴定有什么用？谁需要做？

答：  只要您使用细胞从事相关研究或生产工作，都强烈建议进行细胞STR鉴定。主要应用领域包括：

        学术研究：医学、遗传学、药物开发、疫苗研制、生物技术、再生医学、干细胞、肿瘤、免疫细胞治疗、病毒检测

、基础细胞生物学等

        工业生产：生物制品（疫苗/抗体/重组蛋白）生产用细胞基质的质量控制

        临床转化：CAR-T/NK/MSC等治疗性细胞产品的GMP级放行检测

通过细胞STR鉴定，您可以：

        ① 判断您培养的细胞是否被其他细胞交叉污染及可能的污染来源；

        ② 明确自己正在使用的细胞是否"正确"；

        ③ 满足Nature/Science等顶刊及其他越来越多的期刊对投稿的强制性要求。

2、我的细胞没有文献报道的STR数据，还能做吗？

答：当然可以！即使我们的数据库中没有您细胞系的参考STR数据，我们仍然强烈建议您进行鉴定：

        ① 判断您的细胞是否被其他已有记录的细胞交叉污染；

        ② 您将是第一个获得该细胞系STR数据（"DNA指纹"）的研究者；

        ③ 该细胞系的STR数据将被保存在我们的数据库中，方便您以后调用和持续比对监测。

提示：对于完全没有参考数据的物种，还可以考虑搭配我们的 mtDNA 种属鉴定服务，先确定物种归属。

3、不做顶级期刊发文章，还有必要做吗？

答：非常有必要，理由如下：

        ① 不只是Nature/Science——目前越来越多各级别杂志都陆续要求投稿者提供细胞鉴定数据，这已成为学术出

版的趋势性要求；

        ② 即使不发表论文，如果使用了错误或被污染的细胞导致得出不可靠的实验结论，多年的心血都可能白费；

        ③ 从科研诚信角度，细胞鉴定正在成为"负责任研究的标配"，就像Western Blot要展示原始胶图一样自然。

4、如何送样？有什么注意事项？

答：推荐送样方式：直接寄送细胞沉淀（首选）

        操作方法：用PBS将细胞洗涤2遍 → 收集细胞于干净无菌离心管中 → 离心去上清 → 获得细胞沉淀

        数量要求：细胞数 ≥ 10⁶ 个（约肉眼明显可见的沉淀量）

        包装要求：封口膜封好管口防止泄漏，随冰袋冷藏寄送

 注意事项：

        • 不建议直接送检自行提取的基因组DNA（质量难以保证，影响鉴定准确性）

        • 请勿同时寄送多个不同细胞样品在同一包裹中（避免交叉污染）

        • 请在委托书中准确标注每个样品的名称和预期物种

5、可以进行人干细胞系（iPSC/ESC/MSC）鉴定吗？

答：完全可以。目前我们的细胞系STR数据库已包含2000余株人胚胎干细胞（hESC）、诱导多能干细胞（hiPSCs）、间

        充质干细胞（MSC）等干细胞的STR数据，可以对这些特殊细胞类型进行准确的身份鉴定和交叉污染排查。

6、STR鉴定和mtDNA鉴定应该选哪个？

答：两者各有侧重，可根据实际需求选择：

        只做STR：适用于已知物种（人或小鼠），需要精确到具体细胞株的场景

        只做mtDNA：适用于怀疑跨种属污染、或细胞来源不明确的初步筛查

        两者联用（推荐）：首次鉴定、高风险样品、或GMP级别质控——STR精确定位 + mtDNA广谱排除，双重保障

7、检测周期多久？可以加急吗？

答：

参考文献：

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